หลังจากที่มงกุฎของราชาเนปจูนถูกขโมยไป “The SpongeBob SquarePants Movie” สปอนจ์บ็อบและแพทริกก็ออกเดินทางตามหามงกุฎนั้นเป็นเวลา 6 วัน สปอนจ์บ็อบออกจากบิกินีบอตทอมเพื่อตามหามงกุฎกับแพทริก
“สพันจ์บ็อบ สแควร์แพ็นท์ เดอะมูฟวี่” สปอนจ์บ็อบและแพทริกใช้สมองและทองแดงของตนปราบเหล่าร้ายมากมายระหว่างทาง ในขณะที่เรื่องนี้กำลังเกิดขึ้น มีคนกำลังเข้าควบคุมทูพีซเบส และสปอนจ์บ็อบกับแพทริกควรจะเอาชนะความอัจฉริยะนี้ได้
